MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 chromosome

Total Repeats: 93958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015564	GGA	2	6	271890	271895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917936
5502	NC_015564	CGAT	2	8	271940	271947	25 %	25 %	25 %	25 %	333917936
5503	NC_015564	GTG	2	6	271978	271983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917936
5504	NC_015564	AGT	2	6	271986	271991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917936
5505	NC_015564	GTC	2	6	272035	272040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917936
5506	NC_015564	CG	3	6	272091	272096	0 %	0 %	50 %	50 %	333917936
5507	NC_015564	AC	3	6	272285	272290	50 %	0 %	0 %	50 %	333917937
5508	NC_015564	CGGTCG	2	12	272311	272322	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333917937
5509	NC_015564	CGC	2	6	272334	272339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917937
5510	NC_015564	CGC	2	6	272354	272359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917937
5511	NC_015564	ACCCGA	2	12	272385	272396	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	333917937
5512	NC_015564	CCG	2	6	272546	272551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917937
5513	NC_015564	GTG	3	9	272571	272579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917937
5514	NC_015564	CGCTGC	2	12	272656	272667	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	333917937
5515	NC_015564	GCGCG	2	10	272696	272705	0 %	0 %	60 %	40 %	333917937
5516	NC_015564	CCA	2	6	272743	272748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917937
5517	NC_015564	CGT	2	6	272762	272767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917937
5518	NC_015564	ATG	2	6	272783	272788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917937
5519	NC_015564	AAG	2	6	272806	272811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917937
5520	NC_015564	CCT	2	6	272827	272832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917938
5521	NC_015564	TG	4	8	272899	272906	0 %	50 %	50 %	0 %	333917938
5522	NC_015564	GCT	2	6	272932	272937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917938
5523	NC_015564	TCT	2	6	273007	273012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917938
5524	NC_015564	ACT	2	6	273027	273032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917938
5525	NC_015564	GC	3	6	273036	273041	0 %	0 %	50 %	50 %	333917938
5526	NC_015564	CTG	2	6	273080	273085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917938
5527	NC_015564	CATCGT	2	12	273091	273102	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	333917938
5528	NC_015564	TGT	2	6	273220	273225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917938
5529	NC_015564	CGT	2	6	273262	273267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917938
5530	NC_015564	TCA	2	6	273292	273297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917938
5531	NC_015564	TG	3	6	273323	273328	0 %	50 %	50 %	0 %	333917938
5532	NC_015564	GCG	2	6	273332	273337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917938
5533	NC_015564	ACC	2	6	273349	273354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917938
5534	NC_015564	GGC	2	6	273364	273369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917938
5535	NC_015564	CG	3	6	273410	273415	0 %	0 %	50 %	50 %	333917938
5536	NC_015564	TGG	2	6	273426	273431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917938
5537	NC_015564	CGA	2	6	273436	273441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917938
5538	NC_015564	GC	3	6	273466	273471	0 %	0 %	50 %	50 %	333917938
5539	NC_015564	ACGGC	2	10	273490	273499	20 %	0 %	40 %	40 %	333917938
5540	NC_015564	GAA	2	6	273517	273522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917938
5541	NC_015564	TCG	2	6	273576	273581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917938
5542	NC_015564	GGC	2	6	273668	273673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917938
5543	NC_015564	GGCG	2	8	273687	273694	0 %	0 %	75 %	25 %	333917938
5544	NC_015564	GATCA	2	10	273701	273710	40 %	20 %	20 %	20 %	333917938
5545	NC_015564	AGGT	2	8	273729	273736	25 %	25 %	50 %	0 %	333917938
5546	NC_015564	GACG	2	8	273763	273770	25 %	0 %	50 %	25 %	333917938
5547	NC_015564	CGG	2	6	273823	273828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917938
5548	NC_015564	CT	3	6	273845	273850	0 %	50 %	0 %	50 %	333917938
5549	NC_015564	GGCT	2	8	273857	273864	0 %	25 %	50 %	25 %	333917938
5550	NC_015564	CGT	2	6	273880	273885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917938
5551	NC_015564	CACCC	2	10	273899	273908	20 %	0 %	0 %	80 %	333917938
5552	NC_015564	AGC	2	6	274097	274102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917939
5553	NC_015564	CAGC	2	8	274149	274156	25 %	0 %	25 %	50 %	333917939
5554	NC_015564	GCC	2	6	274163	274168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917939
5555	NC_015564	GCTG	2	8	274174	274181	0 %	25 %	50 %	25 %	333917939
5556	NC_015564	AGG	2	6	274224	274229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917939
5557	NC_015564	CGA	2	6	274302	274307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917939
5558	NC_015564	CGTT	2	8	274308	274315	0 %	50 %	25 %	25 %	333917939
5559	NC_015564	TCC	2	6	274412	274417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917939
5560	NC_015564	CGC	2	6	274573	274578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917939
5561	NC_015564	TGA	2	6	274623	274628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917939
5562	NC_015564	TGCC	2	8	274650	274657	0 %	25 %	25 %	50 %	333917939
5563	NC_015564	TTCC	2	8	274675	274682	0 %	50 %	0 %	50 %	333917940
5564	NC_015564	TCG	2	6	274735	274740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917940
5565	NC_015564	TGC	2	6	274767	274772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917940
5566	NC_015564	GAT	2	6	274793	274798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917940
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5568	NC_015564	CCA	2	6	274841	274846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917940
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5570	NC_015564	CGG	2	6	274913	274918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917940
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5573	NC_015564	CG	3	6	274981	274986	0 %	0 %	50 %	50 %	333917940
5574	NC_015564	GCC	2	6	275001	275006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917940
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5578	NC_015564	GAT	2	6	275166	275171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917940
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5587	NC_015564	CTG	2	6	275541	275546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917940
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5589	NC_015564	AGAA	2	8	275722	275729	75 %	0 %	25 %	0 %	333917940
5590	NC_015564	GAT	2	6	275772	275777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917940
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5592	NC_015564	GC	3	6	275969	275974	0 %	0 %	50 %	50 %	333917941
5593	NC_015564	CGC	2	6	276006	276011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917941
5594	NC_015564	GCTCA	2	10	276109	276118	20 %	20 %	20 %	40 %	333917941
5595	NC_015564	ATC	2	6	276254	276259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917941
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5602	NC_015564	GTGC	2	8	276795	276802	0 %	25 %	50 %	25 %	333917941
5603	NC_015564	GT	3	6	276803	276808	0 %	50 %	50 %	0 %	333917941
5604	NC_015564	TGA	2	6	276892	276897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917942
5605	NC_015564	GGAA	2	8	277139	277146	50 %	0 %	50 %	0 %	333917942
5606	NC_015564	GAC	2	6	277197	277202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917942
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5608	NC_015564	GAT	2	6	277298	277303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917942
5609	NC_015564	CAG	2	6	277309	277314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917942
5610	NC_015564	CG	3	6	277329	277334	0 %	0 %	50 %	50 %	333917942
5611	NC_015564	ACG	2	6	277368	277373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917942
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5617	NC_015564	GCA	2	6	277932	277937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917943
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5619	NC_015564	GGA	2	6	277998	278003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917943
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5621	NC_015564	GGA	2	6	278199	278204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917943
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5987	NC_015564	GGC	2	6	296572	296577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917963
5988	NC_015564	ACT	2	6	296635	296640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917963
5989	NC_015564	GC	3	6	296692	296697	0 %	0 %	50 %	50 %	333917963
5990	NC_015564	CGAG	2	8	296730	296737	25 %	0 %	50 %	25 %	333917963
5991	NC_015564	GGT	2	6	296739	296744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917963
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